COVID-19
Dokumenty a pokyny, zejména pro lékaře a odbornou veřejnost
Léková žádanka, indikace a medikace
- Léková žádanka v informačním systému infekčních nemocí ISIN (pdf, 1 MB)
- Mezioborová stanoviska k léčbě pacientů s COVID-19
eŽádanka k vyšetření
- Testování ve firmách – manuál (pdf, 281 kB)
- Informace k eŽádance na vyšetření COVID-19 (pdf, 1,2 MB)
- Informace k eŽádance na vyšetření COVID-19 – verze s vyznačením revizí (pdf, 1,2 MB)
- Číselník obcí (xlsx, 1,0 MB)
- Na koho se obrátit v případě problémů
- Modul Pacienti COVID-19 pro indikující subjekty a praktické lékaře (pdf, 1,0 MB)
Očkování
- Očkovací portál občana (pdf, 450 kB)
- Metodický pokyn pro ruční zaznamenání očkování v informačním systému infekčních nemocí ISIN – praktičtí lékaři – verze 1.1 (pdf, 1 MB)
- Metodický pokyn pro ruční zaznamenání očkování v informačním systému infekčních nemocí ISIN – ostatní poskytovatelé – verze 5.1 (pdf, 1,4 MB)
- Datové rozhraní (API) pro očkování v informačním systému infekčních nemocí ISIN – verze 5.0 (pdf, 260 kB)
Laboratoře
- Datové rozhraní a metodika pro zasílání výsledků laboratorních vyšetření (verze 1.13) (docx, 30 kB)
- Datové rozhraní a metodika pro zasílání výsledků laboratorních vyšetření – vzorové soubory (zip, 10 kB)
Rezervační systém na testy (není provozován ÚZIS ČR)
- Zpracování rezervací na antigenní testy – metodika pro operátory (pdf, 200 kB)
- Zpracování rezervací na antigenní testy – práce s rezervacemi (pdf, 260 kB)
Klasifikace
- Mezinárodní pokyny pro certifikaci a klasifikaci onemocnění COVID-19 jako příčiny úmrtí (pdf, 600 kB) (český překlad oficiálních pokynů WHO International Guidelines for Certification and Classification (Coding) of COVID-19 as Cause of Death)
- Pokyny ke kódování onemocnění COVID-19
- Pokyny pro certifikaci a kódování mortality v souvislosti s onemocněním COVID-19
- Mimořádná aktualizace MKN-10 v souvislosti s epidemií COVID-19
Ostatní dokumenty a odkazy
- Příjezdový formulář (pdf, 490 kB)
- COVID-19: Přehled aktuální situace v ČR (webová aplikace)
- Protiepidemický systém ČR
Prezentace, analýzy
- Stručný souhrn epidemiologické situace, průběh vakcinace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 29. 1. 2021) - Aktuální epidemiologická situace, systém testování a trasování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 29. 1. 2021) - COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 29. 1. 2021) - Dezinformace a dezinterpretace v souvislosti s COVID-19
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 29. 1. 2021) - Stručný souhrn epidemiologických dat
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 8. 1. 2021) - Aktuální epidemiologická situace, systém testování a trasování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 8. 1. 2021) - COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 8. 1. 2021) - Připravené změny v Indexu rizika a v Protiepidemickém systému (PES)
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 5. 1. 2021) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 18. 12. 2020) - Dezinformace a dezinterpretace v souvislosti s COVID-19
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 18. 12. 2020) - Informace k dobrovolnému bezplatnému preventivnímu testování veřejnosti antigenními testy
(prezentace plk. Petra Šnajdárka z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 18. 12. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 12. 2020) - Dobrovolné preventivní testování antigenními testy k průkazu SARS-CoV-2 u pedagogických pracovníků a veřejnosti
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 12. 2020) - Co pomáhá?
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 12. 2020) - Postoje české veřejnosti k plošnému testování a očkování proti COVID-19
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 12. 2020) - Zajištění očkování proti COVID-19 v ČR
(prezentace dr. Zdeňka Blahuty z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 12. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 4. 12. 2020) - Aktuální epidemiologická situace, systém testování a trasování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 4. 12. 2020) - COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 4. 12. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 27. 11. 2020) - Aktuální epidemiologická situace, systém testování a trasování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 27. 11. 2020) - COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 27. 11. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 13. 11. 2020) - Aktuální epidemiologická situace, systém testování a trasování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 13. 11. 2020) - Protiepidemický systém ČR PES
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 13. 11. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 11. 2020) - COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 11. 2020) - Aktuální epidemiologická situace a výsledky trasování a testování
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 11. 2020) - Principy vývoje nového rizikového skóre COVID-19 pro kraje
(prezentace doc. Jana Blatného z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 11. 2020) - Vývoj epidemie COVID-19 v ČR, souhrn hlavních statistických ukazatelů
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 30. 10. 2020) - Nákaza COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 30. 10. 2020) - Aktuální epidemiologická situace
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 30. 10. 2020) - Datová a informační základna pro management pandemie COVID-19
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 16. 10. 2020) - Nákaza COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 16. 10. 2020) - Datová a informační základna pro management pandemie COVID-19
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 17. 9. 2020) - Nákaza COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 17. 9. 2020) - Nezbytná protiepidemická opatření
(prezentace prof. Romana Chlíbka z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 17. 9. 2020) - Stručné shrnutí současné epidemiologické situace dle dostupných dat
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR, SMO a ÚZIS ČR ze dne 25. 8. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: Aktuální epidemiologická situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 3. 8. 2020) - Nákaza COVID-19 a systém lůžkové péče ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 3. 8. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: Aktuální epidemiologická situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 27. 7. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: Aktuální epidemiologická situace – celá ČR
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 7. 7. 2020) - COVID-19 – epidemiologická situace lokální ohniska
(prezentace dr. Jarmily Rážové z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 7. 7. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: Aktuální epidemiologická situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 29. 6. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: Aktuální epidemiologická situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 6. 2020) - Systém akutní lůžkové péče v kontextu aktuální situace nákazy COVID-19 v ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 11. 6. 2020) - Datová a informační základna pro management pandemie COVID-19
- (prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 22. 5. 2020)
- Mortalitní data, kódování a vymezení úmrtí na COVID-19
(Šárka Daňková, Miroslav Zvolský, Ladislav Dušek) - Stručný popis koncepce stochastických modelů využívaných pro predikce pravděpodobného vývoje epidemie COVID-19 v ČR
(Ondřej Májek a kolektiv autorů) - Metodický popis užívaných stochastických modelů pro predikce pravděpodobného vývoje epidemie COVID-19 v ČR
(Ondřej Májek a kolektiv autorů) - Vyhodnocení a rekalibrace prediktivního modelu SIR publikovaného dne 8. 4. a 15. 4. 2020
(L. Dušek a kolektiv autorů) - Scénáře pro krátkodobé a dlouhodobé predikční modely
(L. Dušek a kolektiv autorů) - Informační systém ISIN – COVID-19: vývoj epidemiologické situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 5. 2020) - Studie SARS-CoV-2-CZ-Preval: předběžné výsledky
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 5. 2020) - Studie SARS-CoV-2-CZ-Preval: sledování imunitní odpovědi u pacientů s COVID-19 a zajištění kontroly kvality
(prezentace doc. Dalibora Valíka z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 6. 5. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: vývoj epidemiologické situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 30. 4. 2020) - Aktuální stav systému intenzivní péče během epidemie/pandemie COVID-19 v ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 30. 4. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: vývoj epidemiologické situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 23. 4. 2020) - Aktuální stav systému intenzivní péče během epidemie/pandemie COVID-19 v ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 23. 4. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: vývoj epidemiologické situace
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 15. 4. 2020) - Aktuální stav systému intenzivní péče během epidemie/pandemie COVID-19 v ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 15. 4. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: aktualizovaná data
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 8. 4. 2020) - Aktuální stav poskytování intenzivní péče během epidemie/pandemie COVID-19 v ČR
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 8. 4. 2020) - Informační systém ISIN – COVID-19: aktualizovaná data
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 1. 4. 2020) - Zajištění poskytování intenzivní péče pro hospitalizované pacienty s COVID-19
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 1. 4. 2020) - Nová data informačního systému ISIN – COVID-19
(prezentace prof. Ladislava Duška z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 24. 3. 2020) - Dostupnost intenzivní péče pro hospitalizované pacienty s COVID-19
(prezentace prof. Vladimíra Černého z tiskové konference MZ ČR a ÚZIS ČR ze dne 24. 3. 2020) - Datové zdroje analýz COVID-19 v ČR
(Jiří Jarkovský, Ondřej Ngo, Ondřej Májek, Ladislav Dušek)
Datové sady
Data o výskytu onemocnění COVID-19, provedených testech, diagnostikovaných případech, hospitalizovaných a vyléčených pacientech jsou sbírána v tzv. Informačním systému infekční nemoci (ISIN). Většina dat je publikována formou datových sad, které lze využít jak pro informování široké veřejnosti, tak i tvorby vlastních analýz či webových vizualizací a aplikací. Kromě nich jsou k dispozici i datové sady na úrovni krajů, měst a obcí. K nim mají přístup určení zástupci krajských úřadů, krajských hygienických stanic a obcí s rozšířenou působností (ORP), aby byli informováni o aktuální situaci v daném místě a mohli na jejich základě přijímat další rozhodnutí.
Přístup k datovým sadám pro prediktivní modelování
Datové sady pro prediktivní modelování jsou k dispozici zájemcům z řad odborné i široké veřejnosti. Pro přístup je nutné vyplnit žádost; po jejím schválení ze strany MZ je uživateli vytvořen účet a jsou mu zaslány informace o přístupu k datům i k dokumentaci. V tabulce níže uvádíme agregovaný přehled institucí a počty uživatelů, kteří mají k těmto datovým sadám přístup (stav k 16. 2. 2021).
| Instituce | Počet uživatelů | Přístup od |
|---|---|---|
| Univerzita Karlova (4 fakulty) | 14 | květen 2020 |
| Masarykova univerzita (4 fakulty) | 10 | květen 2020 |
| České vysoké učení technické v Praze (4 fakulty) | 18 | září 2020 |
| Vysoké učení technické v Brně (2 fakulty) | 7 | září 2020 |
| CERGE-EI | 3 | květen 2020 |
| Vysoká škola ekonomická v Praze | 11 | září 2020 |
| Česká zemědělská univerzita v Praze | 2 | říjen 2020 |
| Vysoká škola báňská – Technická univerzita Ostrava | 5 | říjen 2020 |
| Západočeská univerzity v Plzni | 3 | září 2020 |
| Univerzita Palackého v Olomouci | 3 | říjen 2020 |
| Ostatní VŠ (ČR) | 8 | září 2020 |
| Akademie věd ČR (3 ústavy) | 6 | říjen 2020 |
| Oxford University | 1 | září 2020 |
| Durham University | 1 | září 2020 |
| University of Michigan | 1 | září 2020 |
| Kaunas Technical University | 1 | říjen 2020 |
| University of Maryland | 1 | únor 2021 |
| Světová zdravotnická organizace | 1 | listopad 2020 |
| Bankovní a finanční sektor | 6 | |
| Státní sektor a společnosti | 33 | |
| Média | 27 | |
| Soukromé společnosti | 56 | |
| Ostatní, soukromé osoby | 121 | |
| Celkem | 339 |